南通中学数学学科素有"数学家摇篮"之称，学科教师秉承"诚恒"之校训，严谨的教风，先进的理念，激发着一代又一代的通中学子对学习数学的兴趣。规范的训练，科学的方法，为通中学子打下了坚实的数学基础，历届校友中：国际知名数学家杨乐、李大潜等是通中学子中的杰出代表。顾一驰、周谦一同学先后入选国家数学奥林匹克集训队，学校每年有3至4人在全国数学竞赛中获一等奖。每年高考通中学子的高考数学成绩均处与高位运行，为学校在历年高考中涌现出一批省、市高考状元和大批高分段考生奠定了坚实基础。

南通中学数学学科现在职教师36人，南通市学科带头人2人、南通市青年科学技术带头人1人、南通市骨干教师3人，拥有一批南通市局直学校学科带头人和骨干教师，高级教师占58%。

南通中学数学学科在全省实施“新课程改革”中，学科老师在秉承通中教育传统的同时锐意改革，积极投入到课堂教学的改革之中，教育与教学科研成果丰硕。学科在“十五”和“十一五”科研期间分别完成了省级课题2个、市级课题2个并且结题；学科教师在中文核心期刊、国家级期刊、省市级期刊发表论文共一百多篇；青年教师参加教学比武一人获全国一等奖、一人省一等奖、6人次获省二等奖。